綠色熒光蛋白（GFP）是由兩個相當規則的內涵一個α2螺旋和外圍保衛11個β2折疊連的β2童裝結構組成的二聚體。蛋白質前段環化形成生色團，結構可以人工改造，從而發出不同波長的熒光，且化學性質穩定，使其具有穩定的發光能力。

藍色激發光源用于綠色熒光蛋白激發
綠色熒光蛋白的生色團在藍色照射下，會吸收藍色部分能量，然后發射出綠色的熒光，利用這一性質，生物學家可以用綠色熒光蛋白來件標記幾乎任何生物分子或細胞，然后在藍色GFP激發光源照射下佩戴LUV-30A觀察眼鏡進行觀察。原本黑暗或透明的視場馬或是那個變得星光點點—即被標記了的活動目標。因為熒光蛋白發射的是熒光而不是磷光，需要GFP激發光源持續存在才可以連續發光。

不僅是綠色熒光蛋白具有被激發光源激發后發出熒光，其他的藍色、青色、紅色……熒光蛋白在相應的激發光源下均發出熒光。